В сложных модельных системах, какими являются региональные системы управления, в условиях многокритериальности при принятии решений применение классических методов оптимизации ограничено сложностью реализации, практически невозможно при неполной информации математически точно сформулировать цели, определить и сформировать оптимальный вариант. Кроме того, существует проблема согласования интересов, связанная с противоречием целей отдельных подсистем, которая на практике приводит к поиску согласованного рационального решения. Поэтому доминирующим в формировании механизма управления экономикой на региональном уровне является метод имитационного моделирования с его экспериментальным подходом как основа для поиска и формирования варианта будущего развития.
Реализация исследования на комплексе имитационных моделей предполагает проведение направленных вычислительных экспериментов, содержание которых определяется предварительно проведенным аналитическим исследованием (как правило, с применением методов социально-экономического прогнозирования), а результаты математически обоснованы.
Процедуры вариантного синтеза могут реализовывать схемы как одноразового выбора, так и последовательного экспериментирования.
Наиболее перспективным направлением в системах принятия решений является разработка методов, объединяющих аналитические методы принятия решений с экспертными процедурами, предназначенные для управления развитием региона.